1929/30 赛季，奥萨苏纳因不满分组结果退出乙级联赛，因此不得不从丙级联赛开启本十年的征程。尽管如此，俱乐部在组织架构与雄心抱负上仍持续成长。这在很大程度上要归功于担任主席的纳塔利奥・卡尤埃拉的治理，以及球场上马丁・何塞・穆吉罗的贡献 —— 穆吉罗是二十年代俱乐部的杰出球员，1931 至 1933 年间出任主教练，正是在他的带领下，球队成功重返乙级联赛。

1932 年，奥萨苏纳迎来了队史最具标志性的球员之一：胡利安・贝尔加拉。这位来自奥利特的前锋是俱乐部历史上进球效率最高的射手，近期研究显示，他在 141 场比赛中攻入 137 球。1934/35 赛季，他成为球队的核心支柱，助力奥萨苏纳实现队史首次甲级联赛升级。

在奥萨苏纳唯一的那个甲级赛季中，胡利安・贝尔加拉攻入 20 球。这一顶级联赛进球纪录保持了九十年，直到 2024/25 赛季，安特・布迪米尔以 21 球将其打破。

1936 年西班牙内战的爆发，中断了俱乐部的上升势头。这场战争让球队大部分球员奔赴前线，他们均效力于佛朗哥阵营。部分现役球员（卡斯蒂略）与前球员（包括贝苏纳特亚、阿维祖里等，共和党阵营的安德烈斯・哈索也在其中）在战乱中丧生；另有现役球员（乌雷亚加、穆吉罗、阿拉纳斯）被流弹击中受伤。而在战场之外，镇压行动夺走了纳塔利奥・卡尤埃拉、埃拉迪奥・西尔韦蒂、拉蒙・本加拉伊、阿尔韦托・拉马斯和福图纳托・阿吉雷的生命，这些人在不同时期都与俱乐部有着紧密的联系。

内战结束后，奥萨苏纳不得不与马德里竞技（当时名为航空竞技）进行一场保级附加赛，以决定哪支球队降入乙级。此前，阿斯图里亚斯因场馆被彻底摧毁而无法参加联赛，奥萨苏纳与马德里竞技成为该赛季联赛的最后两名。最终，纳瓦拉球队在巴伦西亚不敌马德里竞技，陷入了严重的危机。战后时期，俱乐部的生存甚至一度面临严峻威胁。